pysamでSAM/BAMファイルを読み込む・解説

SAMはSequence Alignment Mapの略称で、アライメントしたリードの情報を格納するテキスト形式です。
オプションのヘッダー セクションとアライメントセクションで構成されるタブ区切りのテキスト形式です。